笛卡尔的哲学体系由树根、树干、树枝三部分组：
“树根”部分是“形而上学”，指探求世界根本原理的学问（哲学上通常所说的形而上学指与辩证法相对立的世界观和方法论）。
“树干”部分是“物理学”，指探究自然的学问，与现代所讲的物理有区别。
在希腊文中，“物理”一词的意思是自然。古代欧洲，物理是自然科学的总称。
后来，自然科学分成诸如物理学、化学、生物学、天文学、地质学等学科。
物理学研究的是物质运动最基本最普遍的形式，而且这些运动形式普遍存在于其他高级的、复杂的运动形式之中，因此，物理学所研究的规律具有极大的普遍性。
物理学是一切自然科学的基础，是当代重大工程技术的支柱。通常根据所研究的物质运动的形态和具体对象不同，将物理学分为力学、声学、热学和分子物理学、电磁学、光学、原子物理学、原子核物理学、固体物理学等分支学科，每一分支学科又包含若干更细的分支。
分类随着研究的推进发展，也有变化，如基本粒子物理学、等离子体物理学、凝聚态物理学等，迅速发展并形成新的学科。
“树枝”部分是实用科学，主要包含医学、机械学、伦理学等。
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